Sfoglia per Autore
Single-Cell RNAseq Complexity Reduction
2023-01-01 Cordero, Francesca; Calogero, Raffaele A
Functional-Feature-Based Data Reduction Using Sparsely Connected Autoencoders
2023-01-01 Alessandri, Luca; Calogero, Raffaele A
Using "Galaxy-rCASC": A Public Galaxy Instance for Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2023-01-01 Mandreoli, Pietro; Alessandri, Luca; Calogero, Raffaele A; Tangaro, Marco Antonio; Zambelli, Federico
Single-Cell RNAseq Data QC and Preprocessing
2023-01-01 Olivero, Martina; Calogero, Raffaele A
Single-Cell RNAseq Clustering
2023-01-01 Beccuti M.; Calogero R.A.
MET∆14 promotes a ligand-dependent, AKT-driven invasive growth
2022-01-01 Cerqua, Marina; Botti, Orsola; Arigoni, Maddalena; Gioelli, Noemi; Serini, Guido; Calogero, Raffaele; Boccaccio, Carla; Comoglio, Paolo M; Altintas, Dogus M
Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering
2022-01-01 Avesani, Simone; Viesi, Eva; Alessandrì, Luca; Motterle, Giovanni; Bonnici, Vincenzo; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele; Giugno, Rosalba
Extracellular Vesicles Derived From Plasma of Patients With Neurodegenerative Disease Have Common Transcriptomic Profiling
2022-01-01 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Fantini V.; Pansarasa O.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Calogero R.A.; Cereda C.
Circulating Extracellular Vesicles Contain Liver-Derived RNA Species as Indicators of Severe Cholestasis-Induced Early Liver Fibrosis in Mice
2022-01-01 Fagoonee, Sharmila; Arigoni, Maddalena; Manco, Marta; Olivero, Martina; Bizzaro, Francesca; Magagnotti, Cinzia; Andolfo, Annapaola; Miniscalco, Barbara; Forni, Marco; Todeschi, Stefano; Tolosano, Emanuela; Bocchietto, Elena; Calogero, Raffaele; Altruda, Fiorella
Regulation of CD45 phosphatase by oncogenic ALK in anaplastic large cell lymphoma
2022-01-01 Mura, Giulia; Karaca Atabay, Elif; Menotti, Matteo; Martinengo, Cinzia; Ambrogio, Chiara; Giacomello, Gloria; Arigoni, Maddalena; Olivero, Martina; Calogero, Raffaele A; Chiarle, Roberto; Voena, Claudia
Identification of Teneurin 4 as a novel cancer-stem cell associated antigen and potential biomarker.
2021-01-01 Peppino G., Barutello G., Ruiu R., Arigoni M., Riccardo F., Conti L., Calogero R.A., Quaglino E.
Computational Analysis of circRNA Expression Data
2021-01-01 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression
2021-01-01 Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L.
Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial
2021-01-01 Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca
Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases
2021-01-01 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C.
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2021-01-01 Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service
2021-01-01 Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F.
Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma
2021-01-01 Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R.
Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis
2021-01-01 Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining
2021-01-01 Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| Single-Cell RNAseq Complexity Reduction | 2023 | Cordero, Francesca; Calogero, Raffaele A | |
| Functional-Feature-Based Data Reduction Using Sparsely Connected Autoencoders | 2023 | Alessandri, Luca; Calogero, Raffaele A | |
| Using "Galaxy-rCASC": A Public Galaxy Instance for Single-Cell RNA-Seq Data Analysis | 2023 | Mandreoli, Pietro; Alessandri, Luca; Calogero, Raffaele A; Tangaro, Marco Antonio; Zambelli, Federico | |
| Single-Cell RNAseq Data QC and Preprocessing | 2023 | Olivero, Martina; Calogero, Raffaele A | |
| Single-Cell RNAseq Clustering | 2023 | Beccuti M.; Calogero R.A. | |
| MET∆14 promotes a ligand-dependent, AKT-driven invasive growth | 2022 | Cerqua, Marina; Botti, Orsola; Arigoni, Maddalena; Gioelli, Noemi; Serini, Guido; Calogero, Raffaele; Boccaccio, Carla; Comoglio, Paolo M; Altintas, Dogus M | |
| Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering | 2022 | Avesani, Simone; Viesi, Eva; Alessandrì, Luca; Motterle, Giovanni; Bonnici, Vincenzo; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele; Giugno, Rosalba | |
| Extracellular Vesicles Derived From Plasma of Patients With Neurodegenerative Disease Have Common Transcriptomic Profiling | 2022 | Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Fantini V.; Pansarasa O.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Calogero R.A.; Cereda C. | |
| Circulating Extracellular Vesicles Contain Liver-Derived RNA Species as Indicators of Severe Cholestasis-Induced Early Liver Fibrosis in Mice | 2022 | Fagoonee, Sharmila; Arigoni, Maddalena; Manco, Marta; Olivero, Martina; Bizzaro, Francesca; Magagnotti, Cinzia; Andolfo, Annapaola; Miniscalco, Barbara; Forni, Marco; Todeschi, Stefano; Tolosano, Emanuela; Bocchietto, Elena; Calogero, Raffaele; Altruda, Fiorella | |
| Regulation of CD45 phosphatase by oncogenic ALK in anaplastic large cell lymphoma | 2022 | Mura, Giulia; Karaca Atabay, Elif; Menotti, Matteo; Martinengo, Cinzia; Ambrogio, Chiara; Giacomello, Gloria; Arigoni, Maddalena; Olivero, Martina; Calogero, Raffaele A; Chiarle, Roberto; Voena, Claudia | |
| Identification of Teneurin 4 as a novel cancer-stem cell associated antigen and potential biomarker. | 2021 | Peppino G., Barutello G., Ruiu R., Arigoni M., Riccardo F., Conti L., Calogero R.A., Quaglino E. | |
| Computational Analysis of circRNA Expression Data | 2021 | Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F. | |
| Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression | 2021 | Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L. | |
| Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial | 2021 | Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca | |
| Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases | 2021 | Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C. | |
| Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data | 2021 | Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A. | |
| Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service | 2021 | Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F. | |
| Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma | 2021 | Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R. | |
| Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis | 2021 | Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A. | |
| Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining | 2021 | Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero |
Legenda icone
- file ad accesso aperto
- file disponibili sulla rete interna
- file disponibili agli utenti autorizzati
- file disponibili solo agli amministratori
- file sotto embargo
- nessun file disponibile